疑似病例完成新冠病毒全基因組分析僅需半小時(shí)
發(fā)布時(shí)間：2020-03-04 09:27:26瀏覽次數(shù)：5131
當(dāng)前，針對(duì)新型冠狀病毒的主要檢測(cè)技術(shù)有免疫、PCR和高通量測(cè)序(NGS)三類，其中免疫和PCR方法是一種定向檢測(cè)，可以對(duì)病毒進(jìn)行篩查，適合對(duì)患者標(biāo)本中是否存在病毒進(jìn)行診斷。
高通量測(cè)序作為一種全面的基因組檢測(cè)技術(shù)，雖然它可以有效防止病毒變異產(chǎn)生的漏檢，但因?qū)嶒?yàn)流程耗時(shí)長(zhǎng)，操作繁瑣，尤其是建庫環(huán)節(jié)步驟繁瑣，需要多次轉(zhuǎn)管和移液操作，致使其推廣應(yīng)用受到限制。
基于此，杰毅生物、浙江省疾控中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊(duì)一同聯(lián)手，研發(fā)出中國(guó)首臺(tái)宏基因組全自動(dòng)建庫設(shè)備Cubics。據(jù)悉，該平臺(tái)是不同于核酸檢測(cè)方法的全基因組檢測(cè)技術(shù)，借助AI算法對(duì)基因數(shù)據(jù)的海量分析處理能力，能對(duì)疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列分析比對(duì)；同時(shí)配備基于自主研發(fā)的CNAD技術(shù)（CRISPR等溫檢測(cè)法）研制的針對(duì)新型冠狀病毒的試劑盒。并且，該檢測(cè)試劑盒不依賴PCR儀器，能快速有效地解決醫(yī)院?jiǎn)挝滑F(xiàn)場(chǎng)反應(yīng)需求，實(shí)現(xiàn)快速尋找病原，并進(jìn)行感染診斷。
不過，因全基因組檢測(cè)技術(shù)是對(duì)疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列對(duì)比，每次測(cè)序過程會(huì)產(chǎn)生海量的數(shù)據(jù)，其前處理和數(shù)據(jù)分析都非常費(fèi)時(shí)費(fèi)力。為此，該平臺(tái)還借助阿里達(dá)摩院的AI算法加持，在序列比對(duì)過程中，對(duì)算法增加了分布式設(shè)計(jì)。
據(jù)了解，與傳統(tǒng)新冠肺炎的分析檢測(cè)，該平臺(tái)至少能夠節(jié)省8個(gè)小時(shí)的分析檢測(cè)時(shí)間，僅需半小時(shí)就能將疑似病例完成新冠病毒全基因組分析，可以實(shí)現(xiàn)快速精準(zhǔn)捕捉變異后的病毒序列，二級(jí)結(jié)構(gòu)及三維結(jié)構(gòu)，進(jìn)而精準(zhǔn)檢測(cè)變異病毒，大幅提高疑似病例的確診速度。(生物谷Bioon.com）
