昨日,頂尖學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》在線發(fā)表了一篇關(guān)于新冠病毒的最新研究論文。來自德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校(UT Austin)的一支團(tuán)隊(duì)利用冷凍電鏡技術(shù),揭示了新冠病毒表面S蛋白三聚體的高清結(jié)構(gòu)。這一信息對(duì)于我們了解新冠病毒如何識(shí)別和進(jìn)入細(xì)胞,以及如何對(duì)其設(shè)計(jì)有效的療法或疫苗,有著重要的指導(dǎo)意義。
S蛋白——新冠病毒的攻城錘
如果把人類的細(xì)胞比作是一座防御堅(jiān)固的城池,那么S蛋白就是新冠病毒入侵這座城池的“攻城錘”。具體來看,這是一種三聚體蛋白,有著大量糖基化的修飾。它雖然看起來像一枚長(zhǎng)長(zhǎng)的釘子,卻會(huì)在結(jié)合細(xì)胞表面的受體后,發(fā)生“變形”,將病毒包膜與細(xì)胞膜融為一塊兒,從而將病毒內(nèi)的遺傳物質(zhì)注入細(xì)胞,感染細(xì)胞。
可想而知,如果我們能看清這個(gè)“攻城錘”的模樣,就能見招拆招,找到其中的軟肋,助力開發(fā)出針對(duì)新冠病毒的藥物和疫苗。而冷凍電鏡技術(shù),正是一種能夠讓我們看清蛋白結(jié)構(gòu)的工具。
3D結(jié)構(gòu)揭示作用機(jī)理
根據(jù)最早報(bào)道的新冠病毒基因組序列,研究人員們表達(dá)了新冠病毒S蛋白的膜外結(jié)構(gòu)域(ectodomain),并在蛋白C端引入了兩個(gè)脯氨酸突變,以求起到穩(wěn)定蛋白的作用。先前的論文也表明,這樣的做法在同類冠狀病毒中確實(shí)能起到穩(wěn)定的效果。
在表達(dá)了這些融合前(prefusion)的S蛋白后,利用冷凍電鏡技術(shù),科學(xué)家們獲得了S蛋白的3D結(jié)構(gòu),分辨率達(dá)到了3.5埃(1埃 = 0.1納米)。對(duì)該3D結(jié)構(gòu)的分析發(fā)現(xiàn),其受體結(jié)合域(RBD)會(huì)上下移動(dòng)——向上時(shí),S蛋白能夠通過這個(gè)受體結(jié)合域,與細(xì)胞表面的受體結(jié)合;向下時(shí),與受體結(jié)合的部位就會(huì)隱藏起來。這有點(diǎn)像我們生活中見到的一些USB盤,只有把接口推出后,才能接到電腦上。
作者們?cè)谡撐睦锉硎?,這種特征同樣存在于SARS病毒和MERS病毒中,另外一些親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的冠狀病毒里也可以觀察到這樣的現(xiàn)象。而當(dāng)S蛋白三聚體的三個(gè)受體結(jié)合域都向上抬起,與細(xì)胞表面的受體結(jié)合后,整個(gè)S蛋白的結(jié)構(gòu)就會(huì)因?yàn)椴环€(wěn)定而發(fā)生變化。
與SARS病毒S蛋白的異同
最近,不少研究指出新冠病毒所識(shí)別的受體可能與SARS病毒一樣,都是ACE2。為了評(píng)估這種可能性,研究人員們測(cè)試了兩種病毒與ACE2的結(jié)合能力。研究表明,新冠病毒S蛋白膜外結(jié)構(gòu)域與ACE2的親和力更強(qiáng),比SARS病毒對(duì)應(yīng)S蛋白區(qū)域的結(jié)合能力要高出10-20倍。作者們也在論文里提到,這種高親和力,可能是新冠病毒更容易發(fā)生人傳人的原因。但他們也強(qiáng)調(diào),這只是一種猜測(cè)。為了驗(yàn)證這種猜測(cè)的可能性,我們依舊需要更多的研究。
也正是由于和SARS病毒S蛋白的這些相似性,研究人員們進(jìn)一步評(píng)估了能夠結(jié)合SARS病毒受體結(jié)構(gòu)域的抗體,能否也結(jié)合新冠病毒的受體結(jié)構(gòu)域。然而,盡管這兩種病毒的受體結(jié)合域非常相似,研究中測(cè)試的3種針對(duì)SARS病毒的抗體,都無法結(jié)合新冠病毒的受體結(jié)合域。研究人員們?cè)谡撐睦镏赋?,雖然他們測(cè)試的抗體只代表了極少的結(jié)合表位,但這些結(jié)果也表明,針對(duì)SARS的單克隆抗體未必對(duì)新冠病毒也有活性。因此我們依舊需要基于新冠病毒,開發(fā)有效的抗體和其他療法。
總結(jié)
毫無疑問,新冠病毒疫情的快速傳播,讓疫苗與新藥的研發(fā)變得迫在眉睫。在論文的最后,作者們指出,清晰到原子水平的S蛋白結(jié)構(gòu),能夠更好地幫助新藥研發(fā)人員們?cè)O(shè)計(jì)和篩選小分子藥物,更精準(zhǔn)地指導(dǎo)疫苗設(shè)計(jì)和抗病毒藥物研發(fā),最終加速相應(yīng)醫(yī)療手段的開發(fā)進(jìn)程。(生物谷Bioon.com)